s coleções zoológicas estão depositadas e reunidas em espaços comuns. As coleções que abrigam espécimes preservados em via úmida estão confinadas em espaço distinto daquele utilizado para coleções de espécimes preservados em via seca.

As salas que comportam as coleções são de acesso restrito. Cada curador possui até dois auxiliares de curadoria e somente estes têm acesso às salas das coleções. As salas não apresentam luz solar direta, são mantidas em completa escuridão, refrigeradas e desumidificadas.

Os espécimes conservados em via úmida estão acondicionados em recipientes padronizados (parte). Estes recipientes estão depositados em arquivos deslizantes.

Os espécimes conservados em via seca igualmente estão depositados em arquivos deslizantes. Quanto às coleções  entomológicas,   estas  estão acondicionadas, quando em via seca, em arquivos deslizantes,  armários demadeira e armários de metal. 

Arquivos deslizantes: sala de espécimes conservados em via úmida

Os espécimes pertencentes às séries-tipo estão depositados em ármários de metal e tem acesso restrito aos curadores "senior".

Peixes* (" agnatos" e mandibulados)

Amphibia (sapos, rãs, cobras-cega)

Sauria* (lagartos, anfisbenídeos)

Serpentes (serpentes, cobras)

Chelonia (tartarugas)

Aves (aves/pássaros)

Mammalia (mamíferos)

Annelida (poliquetos, minhocas)

Araneae (aranhas)

Bryozoa (briozoários)

Chelicerata (parte: ácaros e opiliões)

Cnidaria (anêmonas-do-mar)

Coleoptera (besouros)

Crustacea (caranguejos, copépodes)

Echinodermata (estrela-do-mar)

Hymenoptera (abelhas, vespas)

Insecta (insetos - parte)

Lepidoptera (borboletas)

Mollusca (mexilhões, lulas, lesmas)

Myriapoda (centopéias, gongôlos)

Porifera (esponjas)

Scorpiones (escorpiões)